Historický ústav AV ČR, v. v. i. navazuje na tradici Státního ústavu vydavatelského (zal. 1921). V nynější podobě je součástí Akademie věd od jejího založení v roce 1952 (v letech 1970-1990 jako Ústav československých a světových dějin), od 1. ledna 2007 se statutem veřejné vědecké instituce.
V současné době na jeho pracovištích působí více než 50 odborných a vědeckých pracovníků a kolem 20 lidí ve specializovaných funkcích jako bibliografové, knihovníci, techničtí redaktoři, asistenti, grafici a tiskaři.
Badatelský program Historického ústavu je pro léta 2005-2010 vymezen výzkumným záměrem Český dějinný prostor v evropském kontextu. Témata výzkumného záměru jsou soustředěna převážně na problematiku českých a československých dějin od 9. do poloviny 20. století. Sloučením s částí bývalého Ústavu dějin střední a východní Evropy ČSAV v roce 1993 získal Historický ústav badatelské zázemí také v oblasti světových dějin.
Historický ústav dále zajišťuje vydávání profilových časopisů
Český časopis historický a Slovanský přehled a řady oborových periodik a poskytuje ediční, bibliografické, knihovní a komunikační služby vědecké veřejnosti.
Součástí Historického ústavu je knihovna o cca 250 000 svazků a Nakladatelství Historický ústav, které ročně produkuje kolem 14 titulů.