Součástí Mapové sbírky Historického ústavu Akademie věd České republiky, v. v. i. je k roku 2001 cca 1 200 atlasových titulů, reprezentujících starší i novější, domácí i zahraniční atlasovou tvorbu. Atlasy lze rozdělit z věcného hlediska, tj. podle obsahu a účelu, na všeobecně zeměpisné, tematické, školní a kapesní, z chronologického hlediska na atlasy - staré tisky - do roku 1800, atlasy z let 1801-1850, 1851-1918, 1919-1945 a po roce 1945. K nejvíce vyhledávaným atlasům patří staré tisky, podrobné všeobecně zeměpisné atlasy Stielerovy ze 2. poloviny 19. století a národní Atlas Republiky československé z roku 1935. Vývoj školní atlasové kartografie dokumentují dva cenné výtisky školních zeměpisných atlasů, Malý příruční atlas všech částí země od Václava Merklase z roku 1846 a Školní atlas všech dílů země Václava Zeleného z roku 1854.
Atlasy jsou zpřístupněny formou lístkové kartotéky, názvové a tematické, na ústavní počítačové síti v rámci katalogu COMDAT a zčásti ve Výběrovém katalogu atlasů, který obsahuje 215 katalogizačních čísel a byl zpracován v roce 1989 jako první ze zamýšlených evidenčních pomůcek Mapové sbírky Historického ústavu AV ČR, v. v. i. Po definitivním přestěhování sbírky na pracoviště v Prosecké ulici došlo k jejímu novému uspořádání a k přečíslování signatur všech atlasů - nové signatury nejsou v katalogu COMDAT zatím uvedeny. Vyhledávání atlasů však umožňuje převodník ve výpůjčním protokolu knihovny Historického ústavu.
Mapa severní části Olomouckého kraje podle Jana Kryštofa Müllera na mapě Homannova kartografického nakladatelství ze 30. let 18. století v Homannově Atlasu regni Bohemiae z roku 1776 (výřez)
Mapa Antarktidy ve Stielerově Hand Atlasu z roku 1906
Mapa Československa v Atlasu republiky Československé z roku 1935